YFCFY 펜타펩타이드

paper_067에서 설계된 Tyr-Phe-Cys-Phe-Tyr (YFCFY) 펜타펩타이드 (see Lee et al., ACS Nano (2016)). 이 펩타이드는 세 가지 모티프를 결합한다: Tyr 2D-형성 모티프, Phe 강한 π–π 모티프, 그리고 Cys 이황화결합-이량체화 모티프.

서열 특이성

• 다섯 가지 후보 (YFCFY, FYCYF, YFCYF, FYCFY, FFCFF) 중, YFCFY만이 페이싱(faceting)을 달성한다 (see Lee et al., ACS Nano (2016), SI Table S₁).
• YYACAYY-peptide 대비 주요 발전: 순수 탈이온수에서 조립되며, 완충액이 불필요하다 (SI Table S₂).
• 이황화결합-가교 이량체가 조립 활성 형태이며, 단량체는 섬유상 박막만을 형성한다.
• 이량체 전환율은 80 °C에서 하루당 ~21% (see Lee et al., ACS Nano (2016), Fig. 3a).

YFCFY-2D-nanosheet의 전구체. YYACAYY-peptide (paper_038)의 tyrosine-disulfide-2D-assembly 전략을 더 짧고 Phe가 보강된 구조로 일반화한다.

DNA 상호작용 (paper_124, 2019)

peptide-nanopore-membrane 소자에서, 이 펩타이드의 잔기들은 기공 벽을 따라 배열되어 통과하는 DNA와 상호작용한다: Tyr 잔기는 네 가지 DNA 염기와 최대 19개의 수소결합을 형성할 수 있으며; Phe는 DNA 염기 가장자리와 방향족 반데르발스 스태킹을 제공한다 (see Yu et al., Nanotechnology (2019), p. 6, citing refs [44,45]). 이러한 상호작용은 dsDNA 전위 속도를 ~1 bp μs⁻¹로 늦추는 것으로 제안되며 (유사한 ~2.7 nm 직경의 SiNx 기공보다 ~1.8배 느림), 이는 peptide-DNA-interaction-nanopore 항력 효과에 해당한다.